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16016HM - ingé bioinfo . ext

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Ingénieur Bioinformaticien H-F
) – CDD 12 mois
Vous souhaitez intégrer un Institut de recherche d’Excellence guidé par la curiosité, rejoignez-nous…
L’Institut Pasteur, Institut de recherche Interdisciplinaire et Internationale contribue depuis 127 ans à l’histoire de la
science, de la médecine et de la santé publique avec une immense renommée. Fidèle à l’esprit humaniste de son
fondateur, l’Institut Pasteur défend le caractère avant-gardiste nécessaire à la conduite de recherches biomédicales de
pointe.
Les activités de recherche du Centre la Collection de cyanobactéries étudient l’évolution des Cyanobactéries et leur
impressionnante diversité en termes de morphologie, d’écologie, de physiologie et de produits naturels…Ces
caractéristiques leur permettent de coloniser la Terre Missions :
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traiter les données de séquençage haut débit en cours d’acquisition (comparaison de génomes, recherche de
clusters de gènes des voies de synthèse des produits naturels…) et de mettre en forme les résultats des
analyses.
rendre disponible aux autres membres de l’équipe des résultats sous une forme exploitable (Ex : Tableaux de
données, Figures…).
les données à traiter seront principalement des données de DNA-seq mais il y aura aussi pour certaines
souches des données de RNA-seq qui pourront servir à terme a compléter les données génomiques (pour de
l’annotation par exemple).
former les membres de l’équipe à l’exploitation des résultats.
La personne recrutée sera intégrée à l’équipe de la collection des cyanobactéries et sera en forte interaction
avec le hub de bioinformatique et biostatistique.
Profil
souhaité :
Titulaire d’un bac+5, vous avez 4 / 5 ans d’expérience dans le domaine
connaissances théoriques et pratiques :
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Traiter et manipuler les données de séquençage NGS
Produire les résultats dans des formats exploitables (tableaux, figures…)
Comprendre les données génomiques
Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation (Ex : Python, java…).
Maîtriser R (ou une solution équivalente pour produire des graphiques, ex : Matplotlib en python)
Maitrise des outils classiques d’analyse NGS pour le contrôle qualité, le mapping, la recherche de SNP et de
CNV (par ex : Fastqc, bwa, bowtie, IGV, GATK, htseqcount, cutadapt…)
Anglais niveau avancé
Vous êtes intéressé(e) par ce challenge, n’hésitez pas à nous envoyer votre CV et LM avec la réf :
16016HM
par
mail à : recrutement@pasteur.fr ou par voie postale à :
Institut Pasteur – Pôle Recrutement - 28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15.
Direction des Ressources Humaines
21/01/2016
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