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4V291 - Master de science et technologie : mention biologie

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Intitulé de l’UE : DEMARCHE EXPERIMENTALE EN BIOLOGIE
Code de l’UE : 4V291
Responsable de l’UE :
Secrétariat :
Jérôme LACOSTE, Maître de Conférences
Mel : jerome.lacoste@upmc.fr
Clémence NOUAILLE
Tél. : 01 44 27 88 85
Mel : clemence.nouaille@upmc.fr
1. Descriptif de l’UE
Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage, autre) : 120 h (116 h TP + 4 h tutorat)
Nombre de crédits de l’UE : 9 ECTS
Mention de master où l’UE est proposée : Mention "Biologie Moléculaire & Cellulaire"
Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 2 du Master
Effectifs prévus : 25
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
Cette unité d'enseignement a pour objectif d'apprendre aux étudiants, de manière non didactique, à
concevoir et à réaliser un projet de recherche dont ils ont eux-mêmes choisi le sujet. Dans ce contexte, le rôle des enseignants n’est plus de poser aux étudiants des questions dont les réponses seraient connues, mais de les aider à résoudre des questions qu’ils se sont eux-mêmes posés. Elle est
organisée sous forme de travaux pratiques intégrés et se structure en trois phases :
• Élaboration libre d’un sujet de recherche à partir d’un thème scientifique et d’un matériel biologique défini (analyse des données bibliographiques, définition d’une problématique, élaboration
d’hypothèses) et définition des procédures expérimentales.
• Réalisation des expériences.
• Analyse des résultats obtenus et mise en forme en vue d’une communication scientifique.
La réalisation du projet se fait dans un contexte de grande liberté/responsabilité et de grande autonomie/interdépendance à tous les niveaux. Les enseignants seront disponibles pour discuter les différentes étapes, sans se substituer à l’étudiant qui reste maître de son projet tant conceptuellement
qu'expérimentalement. A tout moment de ce processus, les étudiants peuvent venir demander des
conseils aux enseignants qui, ne connaissant pas à l’avance les résultats des expérimentations, sont
dans la même situation qu’eux et donc dans un réel contexte de recherche expérimentale en biologie. Ces objectifs concernent aussi bien les étudiants qui se destinent à la recherche expérimentale,
où l’acquisition d’un réel savoir-faire méthodologique et pratique devrait constituer un point fort de
leur formation (en particulier vis-à-vis des laboratoires d’accueil), que les étudiants qui se destinent
à la maîtrise et l’encadrement en entreprise où une compétence et une rigueur dans la conduite
autonome d’un projet seront appréciées.
b) Thèmes abordés
Le thème scientifique choisi est l’étude du stress oxydant chez la levure S. cerevisae, avec un intérêt
particulier pour le rôle de la catalase. Ce thème constitue un pôle central dans de nombreuses thématiques scientifiques (apoptose, homéostasie et réponse aux stress, signalisation, pathologie, en
particulier du vieillissement, …). Le modèle expérimental eucaryote choisi permet la mise en
oeuvre de techniques de biologie cellulaire et moléculaire et de biochimie offrant ainsi la possibilité
aux étudiants de mettre en pratique leurs connaissances théoriques.
c) Organisation pédagogique
Organisation des 3 phases : la première période (enseignement non présentiel + tutorat) est destinée
à l’élaboration du projet scientifique et des procédures expérimentales. Les binômes d'étudiants
auront à leur disposition un polycopié résumant la thématique scientifique générale du TP avec
toutes les références bibliographiques suffisantes à la conception de leur sujet de recherche ainsi
qu'un polycopié non exhaustif des expériences pouvant être menées dans le service de travaux pratiques. La seconde période (enseignement présentiel, quatre semaoines à plein temps) est réservée à
la réalisation expérimentale. Les conditions de travail seront identiques à celles existantes en laboratoire : gestion du matériel, préparation de l’ensemble des produits, solutions et milieux nécessaires,
gestion du temps, échecs expérimentaux, résultats inattendus, … La troisième période (enseignement non présentiel + tutorat) est consacrée à l’élaboration d’une communication scientifique écrite
et orale, sur laquelle reposera l’évaluation finale.
d) Pré-requis
Aucun pré-requis n'est exigé pour suivre cette unité d'enseignement.
3. Equipe pédagogique
Animateur de l’équipe : Jérôme Lacoste.
Tutorat et Travaux Pratiques : Agnès Audibert, Pierre-Louis Blaiseau, Yvan Kraepiel, Jérôme Lacoste, Sophie Louvet-Vallée, Sandrine Lanfranchi, Jacques Pedron et Juliette Puyaubert.
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