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4V007 - Master de science et technologie : mention biologie

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Intitulé de l’UE : STRUCTURE ET FONCTION DES GENOMES
Code de l’UE : 4V007
Responsable de l’UE :
Secrétariat :
Nathalie DOSTATNI, Professeur
Mel : Nathalie.Dostatni@curie.fr
Carine JOSEPH
Tél. : 01 44 27 35 35
Mel : Carine.Joseph@upmc.fr
1. Descriptif de l’UE
Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage, autre) : 60 h (32 h CM + 28 h TD)
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Mention de master où l’UE est proposée : Biologie Moléculaire & Cellulaire
Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 1 du Master
Effectifs prévus : 80
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
Le séquençage haut débit et les techniques modernes d’analyse des génomes ont révolutionné la
biologie et ont généré une source innombrable de données. Cette unité d'enseignement se propose
de faire le point sur les mécanismes génétiques et épigénétiques mis en évidence par ces nouvelles
approches, leur apport dans la compréhension des mécanismes évolutifs et de leur sélection, des
interactions entre les gènes, du rôle de l’épigénome et l’importance de ces différents processus dans
la genèse des organismes ou des populations. L’accent est mis sur les approches méthodologiques,
de génétique moléculaire ou de génomique fonctionnelle, utilisées aujourd’hui pour caractériser les
interactions entre les gènes ou entre les gènes et leur environnement. Les conséquences du dysfonctionnement de ces mécanismes sur le développement de pathologies chez l’homme, en particulier le
cancer, une maladie dont l’évolution met en jeu des principes de sélection et d’évolution des génomes, seront abordées. Ce module fait appel à des notions de génétique, de biologie cellulaire et de
biochimie.
b) Thèmes abordés
- Structure des génomes eucaryotes (composition et organisation structurale des grands génomes).
- Mécanismes d’évolution des génomes (réplication, réparation, recombinaison)
- Dynamique des génomes (nature et propriétés de leurs constituants).
- Forces évolutives, sélection.
- Organisation fonctionnelle des génomes (réseaux d'interactions fonctionnelles conditionnant l'activité des gènes).
- Manipulation de données issues d'expériences "haut débit" afin d'en tirer des informations exploitables et de répondre à des questions biologiques.
- Architecture et compartimentation nucléaire (organisation du génome dans l'espace nucléaire, expression génétique site-spécifique).
- Paysages épigénétiques : analyse de l'épigénome.
- ARN non codant
c) Organisation pédagogique
L'unité d'enseignement est organisée sur quatre semaines à mi-temps avec deux heures d'enseignement magistral le matin et deux heures de travaux dirigés en relation directe avec le contenu des
cours et qui se déroulent un après-midi sur deux.
d) Pré-requis
Les prérequis pour suivre l'unité d'enseignement 4V007 correspondent à une bonne maitrise des
concepts suivants :
- la structure et l'organisation des génomes,
- les différents niveaux de la diversité génétique,
- les bases des mécanismes moléculaires de la réplication et de la réparation,
- les mécanismes d'expression des gènes : la transcription et sa régulation ainsi que la traduction,
- les outils moléculaires et le génie génétique.
3. Equipe pédagogique
Animateur de l’équipe : Nathalie Dostatni.
Cours Magistraux et Travaux Dirigés : Valérie Borde, Frédéric Devaux, Nathalie Dostatni, Iréna
Draskovic, Alexandre Escargueil, Gilles Fischer, Dominique Higuet, Stéphane Koundrioukoff,
Ingrid Lafontaine, Stéphane Le Crom, Emmanuèle Mouchel-Viehl, Marina Pinskaya,
Sophie Polo.
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